Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
KLHL4Q9C0H6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms