Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BCO2Q9BYV7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms