Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC4A5Q9BY07 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC4A5Q9BY07 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC4A5Q9BY07 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms