Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms