Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RSG1Q9BU20 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RSG1Q9BU20 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RSG1Q9BU20 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RSG1Q9BU20 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RSG1Q9BU20 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RSG1Q9BU20 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RSG1Q9BU20 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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