Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms