Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGIP1Q9BQI5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms