Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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USP47Q96K76 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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USP47Q96K76 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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USP47Q96K76 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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USP47Q96K76 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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USP47Q96K76 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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USP47Q96K76 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP47Q96K76 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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