Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms