Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms