Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HPS3Q969F9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms