Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms