Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC71Q8IV32 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC71Q8IV32 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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