Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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