Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SDK2Q58EX2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SDK2Q58EX2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms