Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF827Q17R98 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms