Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM187BQ17R55 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms