Protein–RNA interactions for Protein: Q16678

CYP1B1, Cytochrome P450 1B1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP1B1Q16678 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYP1B1Q16678 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms