Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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GABRA6Q16445 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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GABRA6Q16445 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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GABRA6Q16445 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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GABRA6Q16445 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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