Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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VAMP3Q15836 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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VAMP3Q15836 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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VAMP3Q15836 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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VAMP3Q15836 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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VAMP3Q15836 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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VAMP3Q15836 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VAMP3Q15836 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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