Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms