Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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