Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms