Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
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