Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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