Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3AQ14563 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA3AQ14563 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms