Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARF1Q14162 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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