Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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