Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CBX3Q13185 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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