Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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