Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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STRN3Q13033 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
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STRN3Q13033 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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STRN3Q13033 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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STRN3Q13033 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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STRN3Q13033 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
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STRN3Q13033 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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STRN3Q13033 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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STRN3Q13033 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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STRN3Q13033 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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STRN3Q13033 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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STRN3Q13033 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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STRN3Q13033 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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