Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms