Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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