Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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FOXD4Q12950 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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FOXD4Q12950 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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FOXD4Q12950 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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FOXD4Q12950 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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FOXD4Q12950 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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FOXD4Q12950 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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FOXD4Q12950 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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FOXD4Q12950 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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