Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms