Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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