Protein–RNA interactions for Protein: Q12756

KIF1A, Kinesin-like protein KIF1A, humanhuman

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1AQ12756 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1AQ12756 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1AQ12756 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1AQ12756 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KIF1AQ12756 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1AQ12756 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KIF1AQ12756 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1AQ12756 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1AQ12756 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1AQ12756 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIF1AQ12756 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms