Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNB2Q08289 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms