Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms