Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL9Q07325 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms