Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAD51Q06609 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD51Q06609 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms