Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPB1Q06547 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms