Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms