Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP7AQ04656 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms