Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MS4A2Q01362 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms