Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MDM2Q00987 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MDM2Q00987 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms