Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FAM3AP98173 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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FAM3AP98173 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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FAM3AP98173 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FAM3AP98173 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FAM3AP98173 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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FAM3AP98173 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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FAM3AP98173 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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FAM3AP98173 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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FAM3AP98173 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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