Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HBBP68871 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HBBP68871 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms