Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms