Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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ACTBP60709 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACTBP60709 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACTBP60709 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACTBP60709 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACTBP60709 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACTBP60709 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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ACTBP60709 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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ACTBP60709 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ACTBP60709 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ACTBP60709 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTBP60709 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ACTBP60709 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTBP60709 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTBP60709 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ACTBP60709 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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ACTBP60709 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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ACTBP60709 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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